药师咒来自《药师琉璃光如来本愿功德经》。药师琉璃光如来，是东方净土净琉璃世界的教主。药师法注重利益现实人间，故特别契合当今时代的众生。持药师咒是易行的药师法门，若能至心修持，不仅有消灾（免除疾病、横逆、贫困等之苦）延寿满愿的利益，还有促使众生早成佛道的功德。即早课十小咒之一。
彼药师琉璃光如来得菩提时。由本愿力观诸有情。遇众病苦瘦疟干消黄热等病。或被厌魅蛊道所中。或复短命或时横死。欲令是等病苦消除。所求愿满。时彼世尊入三摩地。
名曰：「灭除一切众生苦恼」。既入定已。于肉髻中出大光明。光中演说大陀罗尼
尔时光中说此咒已。大地震动。放大光明。一切众生病苦皆除。受安隐乐。曼殊室利。若见男子女人有病苦者。应当一心为彼病人清净澡漱或食或药或无虫水。咒一百八遍与彼服食。所有病苦悉皆消灭。若有所求指心念诵。皆得如意无病延年。命终之后生彼（药师琉璃）世界。得不退转。乃至菩提。是故曼殊室利。若有男子女人。于彼药师琉璃光如来。至心殷重恭敬供养者。常持此咒。勿令废忘！─《药师琉璃光七佛本愿功德经卷下》。《大正藏》第十四册页414中─下。
若有受持此真言，能拔身中过去生死一切重罪，不复经历三涂，免离九横，超越众苦。─《药师如来念诵仪轨》。《大正藏》第十九册页30中。
修行目的非常重要的定律唯心净土，万法唯心造。若要国土净，必先净其国人心。地藏经说：起心动念，无非是业，无非是罪。你们看我们修行，很多蚊子过来骚扰，它们专咬那些人呢？不专心修行的人，为什么？因为不专心修行，脑海里面就妄想纷飞，心净不下来，动来动去的，很燥热，心火就起来了，汗也就不知不觉地流出来了，有了汗味当然蚊子就闻讯赶来，发动攻击了。相反如果我们心地清净，专注于修行，心静自然凉，《药师经》说到：或有水火，刀毒悬险恶象，狮子、虎狼、熊罴、毒蛇、恶蝎、蜈蚣、蚰蜒、蚊虻等怖，若能至心忆念彼佛，恭敬供养，一切怖畏皆得解脱。
我们修行要发利益众生的大菩提心，不要满足于利己的人天福报，做什么大富长者、国王、大臣，要做大导师，像阿弥陀佛一样，做众生的接引导师，这个就像大学里的硕士生导师、博士生导师一样，带领指导众生学习药师法门。我们修行发愿往生东方，就是去那里做药师佛的学生，在那里成就果位，得不退地菩萨位次，乃至成就无上正等正觉。
修药师法门大家会得到药师佛护佑，肯定一个受戒的人总比不受戒的人更上一层法意。放心持戒，多种善因，当来必受善果，而不必怕犯戒而不受戒！
能够信仰此咒，算是难能可贵，因为修行此咒受益良！你们今天种下一颗金刚种子，终有一天会开花结果，而圆满修成正果。
