《吕祖说三世因果经》主要讲：一是人的命是自己造就的；二是怎样为自己造一个好命；三是行善积德与行凶作恶干坏事的因果循环报应规律。因果报应指事物的起因和结果，种什么因，结什么果，宗教认为种什么因，结什么果报。
因果报应有三种：现报，现作善恶之报，现受苦乐之报；生报，或前生作业今生报，或今生作业来生报；速报，眼前作业，目下受报。下面要讲的故事就是因果轮回的验证。
当佛陀在印度舍卫城的时侯，有一位施主的财富很多，就跟多闻天子一样。这位施主虽然学佛，但也不排斥一些外道宗派。他的妻子怀孕九个月后生下一个孩子，具有肤色金黄、头像宝伞等种种瑞相。当小孩会行走玩耍时，施主便买了一只小母狗陪他玩耍。
这只小母狗很聪明，每次见到外道信徒总是跑去咬他们，并咬烂他们的衣服；但见到比丘时，则是摇着尾巴，跑去舔他们的脚，或是绕圈等作一些恭敬的行为。
有一天早上，舍利子以声闻眼观知度化施主的因缘已经成熟，于是着衣持钵到舍卫城化缘。当他走近施主家时，那只母狗远远地跑去迎接尊者，舔舍利子的双足，又摇摇尾巴，恭敬地右绕三匝。施主看见后，心想：“这只狗真有善根！它只不过是只狗，却对比丘这样恭敬，这位比丘肯定是位大德，我应该好好恭敬供养他。”
于是，施主开口邀请舍利子尊者到他家应供，尊者默许。施主心生欢喜，于家中敷设高座，并亲手供养饮食，尊者也如理受食。供养圆满后，施主祈求舍利子传法。舍利子以神通观察他的根机，传授相应的佛法。因为听闻佛法的加持力，施主摧毁了萨迦耶见，证得了预流果。舍利子又与他交谈良久后，才回去。
得果后的施主，生大欢喜，广行布施，其财源如井水般，让蜂涌而来的求施者取之不竭。施主也常请舍利子应供，并代为母狗祈法，舍利子随顺所求为它传法，母狗也恭敬心听受。
这时，施主心想：“我能证果都是因为这只母狗的因缘而来，若不是它去迎接尊者，我也不可能供养尊者。它对我有大恩德，应该好好善侍它。”
有一天，这只母狗生病了，施主请舍利子尊者为它诵经。舍利子尊者对母狗与施主传受：“诸行皆无常，诸行皆痛苦，诸法皆无我，涅槃即寂灭。”并对母狗说：“如果你对我生欢喜心，那么即使堕入畜生界，也能脱离恶道的。”尊者回去后，过了不久，母狗就去世了。
施主前去请问尊者：“我的母狗死了，现在该怎么办？”
尊者对施主说：“将母狗的尸体放于静处，肉体腐烂后的骨架，会有大用处。”施主便按照尊者的吩咐，处理母狗的尸体。
母狗死后，它的神识投胎到施主的家中，成为施主家的女儿。女孩长大后，相貌十分庄严。
有一天，舍利子见到她，叫她去听法，但她正值青春年少，性情娇纵，不肯去。这时，舍利子把静处的母狗骨架，放到她面前。突然，她能够回忆起自己的前世，她心想：“由于舍利子的加持，使我离开傍生界，获得人身，所以尊者对我有恩。我应该立刻到尊者前听法。”
她来到舍利子尊者面前，舍利子观察她的根机，传给她相应的法，她以智能摧毁萨迦耶见，得到预流果。得果后，她披上袈裟，对尊者恭敬顶礼请求：“我希望能在释迦佛的教法下出家，修持清净梵行。”
尊者告诉她：“需征求父母的同意，才可以出家。”
后来，她取得父母同意，舍利子便把她带到比丘尼僧团，让她在摩诃波阇波提长老尼前落发出家，受具足戒。摩诃波阇波提长老尼为她传了相应的法，她精进修学，最终断尽三界烦恼，证得阿罗汉果。
证果后，她对舍利子充满感激之情，经常顶礼尊者，也时常对舍利子说：“尊者，您对我有大恩德。我曾经是傍生，是您把我从傍生界中救出来；我能得圣果，也是您几度传法的缘故。”
舍利子身旁的比丘们因常听见她这么对舍利子说，因而好奇地请问舍利子尊者：“为什么这位比丘尼天天说：‘非常感谢您，您使我从畜生界中得到解脱’呢？”
尊者问他们：“你们是否还记得，舍卫城有位施主家的那只母狗呢？”
“对，对，是有只母狗，它对我们很好。”
尊者说：“它就是这位比丘尼的前世。当时我为它传法，它对我生起无比的欢喜心，死后转生为施主的女儿。她现在能回忆前世，所以常说些感激我的话。”
比丘们听后，对因果生起很大的信心，又到世尊前请问：“世尊！这位比丘尼以什么样的业报转生成一只狗？以什么样的业感转为人身？又是什么因缘能在佛的教法下出家，获证罗汉果位呢？请世尊为我们开示。”
世尊告诉他们：“比丘们！这是她前世的业力与今世的因缘所造成的。在贤劫人寿二万岁迦叶佛出世的时候，当时的印度鹿野苑有一位大施主的女儿，对迦叶佛具有大信心，并在迦叶佛的教法下出家。她精通三学，持戒清净，具足梵行，是一位传授佛法的说法上师。因为她说法度众，得到许多人的供养，但她觉得：‘我一个人享受不了这么多，不如发心将所有财物供养僧众。’于是就把每次所得的供养物，用来供养维持僧众的生活。
有一次，她遇到急事请求僧众帮忙，但僧众因为忙碌的关系，没有一个人能够帮她。这位比丘尼顿时生起大瞋恨心，咒骂僧众：‘我平时对你们事事关照，供养你们，为你们做许多的事情，可是当我遇有急事，却没一个人肯帮忙。你们一点良心都没有，像母狗一样。’
僧众听到她用‘母狗’骂僧众，知道她已造下很大的恶业，便问她：‘你是什么人？我们又是什么人呢？’
那位比丘尼生气地说：‘你们是出家人，我也是出家人。’
僧众告诉她：‘有点不同，虽然都是出家人，但是我们当中有已证得果位的圣者，你还是个凡夫，如此恶口已经造作很大的罪业，会使你在轮回中受苦的，你应该好好地忏悔罪业才是。’
听了这些话，这位比丘尼也觉得言之有理，于是心生悔意，便在后半生中，不断地忏悔，并更加精进行持净戒，她在临终的时候发愿：‘愿我一生持戒、供养的功德，使我生生世世投身富贵之家，相貌庄严，并能在释迦牟尼佛的教法下出家，成为阿罗汉。还希望我在僧众前恶口骂人的罪业不要成熟。’
虽然她这么发愿，但这个恶业最先成熟，并且转生五百世的母狗之后，其它的愿方成熟，到了今世才得以出家证得阿罗汉果。今生的因缘则是，她作母狗的时候，对舍利子尊者生起欢喜心和大信心，以这个欢喜心和大信心，始得以转为人身。”
