称念药师琉璃光如来圣号或持诵药师灌顶真言修持药师经，一定要按照经文所说随力所办，供养具足之法一心诵持、礼拜、围绕，与此药师经思维其意，药师佛的本愿功德正法宝藏就是舍己为人。因地发大愿令众生离一切苦恼，具足一切世出世间所需无令乏少，于病苦者令遇医受药令得除愈。
为危厄说令度苦厄诸横之法，依种种善巧方便令离危厄而能意持正法宝藏发恒求正法之心。以持咒功德加持愿令一切众生离一切病苦除一切苦恼，依药师琉璃光如来利益安乐众生的本愿，而称念药师琉璃光如来名号，愿一切众生离一切病苦、安乐心悦、身如琉璃、内外明澈、净无瑕秽，具足种种功德也能利益安乐无量众生。
