现在来大略谈谈密乘的源流。说到密乘的源流真是千头万绪，想勾出一个轮廓来，都是要整册书的事情，所以本文只能把几个主流说一说，这里先讲龙树菩萨的传承。
关于「东密」，过去有人把它所推重的两部大法和藏密的传承对比，认为东密只不过到了下三部的范围（苏悉地属事部，大日经属行部，摄真实经属瑜伽部），并没有涉及无上瑜伽部之藩篱。不过我们从金刚顶经十八会的内容考察起来，我们可以说「东密」不过不以无上瑜伽部的法门为主，这是它和藏密差别的地方，要说「东密」没有无上部的传承就不大靠得住了。无上瑜伽部，在理论上，以「喜金刚」和「密集」的经轨为根本的典籍，大藏秘要的作者认为金刚顶经第九会一切佛集会祭吉尼纲戒瑜伽就是喜金刚的Tantra（这部经宋朝有译本，名叫大悲空智金刚大教王经），这是对的。因为照金刚顶十八会指归所说该会的名称和内容，和喜金刚本续正相符合。又第十五会秘密集会瑜伽，就是「密集」的Tantra，是毫无问题的（宋代亦有全译本）。另外还有两会，立自身为曼荼罗，呵身外形像，乃至不立观想曼荼罗等，则和西藏旧派中的最高阿底瑜伽法门相一致。所以我们只能说不空三藏没有把无上瑜伽部翻译宏扬，至于学藏密而认为东密没有无上瑜伽部的传承，学东密而訾议藏密的无上瑜伽部不是纯密，都是肤浅而不正确的看法。
莲花生大师的传承《藏密》
正当中国的密乘祖师不空三藏示寂之年（七七四年）莲花生大师应藏王之请由印入藏。传说他于佛入灭后第八年即降生于乌仗那，依阿难为师，其后数百年间广学显密教法，即身证得无量寿智决定光明自在王如来之体，后来和《龙树菩萨》又互礼为师，所以和后来的「禅宗」，「东密」都有相当的渊源。密乘的祖师当中，以他为最早，成就也最高。他入西藏以后所流传下来的一派，就是现在康藏一带所谓宁玛派（Pnylng-ma-pa），俗称红教，上文说的九乘次第，就是他这一派的说法，这一派在印度方面的传承似乎早已断绝，现在除了青康藏一带有他的传承而外，尚有印藏间名叫「锡金」的一个小国，是由红教的喇嘛所建立的。
莲花生大师派的宗见的高超，加持力量的伟大，和证得最高果位的人数的众多，为康藏其他新兴各派所共同尊仰。这主要是因为莲花生大师显教方面得到阿难的亲传教授；密乘方面亲承过普贤如来、五方五佛、金刚萨埵等直接传授，而本身又已得到最高的修证的缘故。本派在元末明初出了一位无垢光大师，精研自宗，同时广学新派密法，及内外教典，着述等身，精湛无比，论者比之龙树、法称，其修证功德，则共许其即身已圆最高果位，为本派杰出人物。到了现代，有一位持明光显金刚洲大师，为莲花生大师现身传法弟子，是康藏方面红教第一大德，并曾入海取藏三次（即莲花生大师在西藏时宝藏的经典，留待后人取用者，这是红教所特有的事情）。大师持灌莲花生大师根本吉祥顶时，可不用任何法器，由弟子自备法木柱、法木板、孔雀尾即能召请护法入坛，威神大振，法力现前，择抉因缘、生死别相，并能在十分钟左右为弟子破瓦开顶插香，由是知者为大德登巴再来于世。修证功德极不可思议。
莲花生大师派以大圆满次第为最高的法门，其直截顿超，就其适应的根机来说，非其他法门所能比拟。佛法中法门无量，以应机为最良，所以我们不应强分高下，但就宗见和行法的差别来说，本派的这个法门，可以说是密乘中最圆顿的教授，是一切乘道的顶首，其他九乘的传承，本派也都具备大圆满的意义和东密金刚顶十八会中所说不用观想，不立身外形像曼荼罗，而立自身为曼荼罗的意义相同，这是可以和「东密」的传承互相参证的地方。
莲花生大师派和上面龙树菩萨派，是密乘方面两个创始最早源远流长的学派。因为这两派的开祖都是融通显密，学贯内外的大师，所以都有囊括干坤涵纳众流的气象与规模，为后起的密乘大师，以宏扬一尊一法为主者所不及。
