佛教开示净土法门，告诉我们大千世界中有许许多多佛土，但特别提倡两处：一是在我们这个世界以西，称西方极乐净土；一是在我们这个世界以东，称东方琉璃净土。西方净土的教主阿弥陀佛，在因地发了四十八大愿，令众生来世往生极乐；而东方净土的药师如来，在因地发了十二大愿，更为重视人生的现世快乐。所以在佛教徒中自然形成这样一种观念：往生西方念阿弥陀佛，消灾延寿念药师如来。
西方净土的弘扬，一向为教界所重视，相关典籍可谓汗牛充栋；而东方药师法门却鲜少有人提倡，这方面的著述更寥寥无几。这一现象也使得社会对佛教产生了诸多误会，认为信佛但求来世快乐而不重视现世的人生，甚至认为佛教乃逃避现实的宗教。近代佛教领袖太虚大师为改变人们这种错误认识，曾大力提倡人间佛教，并亲自讲解过《药师经》，认为可以依药师法门创建人间净土。所以说，药师法门的弘扬是很有现实意义的。
一、 药师誓愿
推动有情流转生死的力量有业力和愿力两种。众生因业力而在六道轮回，圣贤则依愿力而成佛作祖。因此，想成就佛道首先要发愿。说到愿力，人们都会想到四弘誓愿，但这只是一切菩萨的通愿，每位菩萨还有自己的别愿，东方琉璃世界教主药师如来，在因地时曾发了十二大愿。
第一生佛平等愿：成佛时，愿自身光明照耀无边世界，具三十二相，八十种随形好，一切有情与我无异。
第二开晓事业愿：成佛时，愿身如琉璃放大光明，开晓幽冥众生，作诸事业。
第三无尽资生愿：成佛时，愿能以无边智慧方便，令众生受用无尽，永无乏少。
第四安立大道愿：成佛时，愿邪道者安立正道，小乘转大乘。
第五戒行清净愿：成佛时，愿一切有情与我法中修行，具三聚净；既使违犯，闻我名号还能清净。
第六诸根具足愿：成佛时，愿身体下劣、诸根不具、盲聋喑?种种疾病有情，闻我名已，端正黠慧，诸根完具，无有病苦。
第七身心康乐愿：成佛时，愿身患重病有情，闻我名已，健康富乐乃至成佛。
第八转女成男愿：成佛时，愿厌恶女身有情，闻我名已，转成男身，具大丈夫相。
第九回邪归正愿：成佛时，愿有情离外道魔网，出恶见稠林，修菩萨道乃至成佛。
第十从缚得脱愿：成佛时，愿为王法制裁，身心受苦有情，闻我名已，痛苦解脱。
第十一得妙饮食愿：成佛时，愿食心渴所逼有情，闻我名已，先得美食后餐法味。
第十二得妙衣具愿：成佛时，愿寒冷无衣有情，闻我名已，先得上妙衣服，后具种种庄严具。
十二大愿体现了药师如来的慈悲和伟大。他给予众生所需要的一切：衣食、健康、娱乐、教育乃至未来的幸福。十二大愿与弥陀四十八愿显然不同：弥陀愿力是成就极乐国土的庄严殊胜，愿众生往生彼国；药师愿力则从有情现世利益出发，贫困的给予衣食，缺陷的令其完善，病患的加以救治，苦痛的施以安乐，邪道的引入正道，堕落的使其超升，从而令人类达到和乐生存的境地，难怪众生有困难之时总要念药师如来。
二、消灾免难
人活着总希望能平平安安的过日子，可有时难免出现灾难：比如大自然的水灾、火灾、风灾、地震、人为的战争、野兽的侵犯，以及来自幽冥的横祸，种种不详和灾难给人类带来了无尽的痛苦，此时，我们倘若能一心称药师如来名号，祈求药师如来的加被，就能消灾免难，逢凶化吉。
1、救国土难：一个国家会面临种种灾难，诸如瘟疫流行、敌国侵逼、国内叛乱、星宿变怪、非时风雨、过时不雨等等。此时，只要大家齐心协力地诵念药师如来名号，建立药师法会，由此善根和药师如来的本愿力量，就能使国家安宁，风调雨顺，谷稼成熟，一切恶相都不显现。
2、百怪出现难：有人梦中看到种种恶相，或有不详的怪鸟突然聚集到家中，或者在房屋的住处出现巨响，骤然发生这些不详的预兆，一定会让我们忐忑不安。此时如果以众妙资具恭敬供养药师如来，恶梦恶相及诸不详物都能隐没。
3、一切怖畏难：当水灾、刀毒、悬险、恶象、狮子、虎狼、熊罴、毒蛇、蜈蚣、蚰蜒等怖畏现象出现在面前时，如能忆念药师如来并恭敬供养，一切怖畏都能解脱。
4、女人生产难：女人在临产时要遭受极大苦痛，如能至心称念药师如来句号，礼赞供养，众苦都能消除，而所生的孩子也能身分具足，相貌端正，见者欢喜，聪明伶俐，安隐少病，无有非人夺其精气。
人世间的灾难都是我们的业力所感，业有共业和不共业。共业是大家都能感受到的，如自然灾害所带来的痛苦；不共业则是唯有个人才能感受的。业由心造，然而，心既能造业也能改变业力，当灾难将要来临时，我们如能改变自己的心态，真诚忏悔，去恶修善，同时至心诵念药师如来名号，依彼如来本愿和功德的力量，就能消灾免难；如果三业依然故我，既使诵念供养药师如来，也是没有用的。
三、除病延寿
健康长寿是人人都希望的，但伴随色身而来的生老病死任何人都不能幸免。有病就不能健康的生活，就面临着死亡的威胁。面对这一切，我们该怎么办？求医吃药是一方面，但医药治病的能力非常有限，世上许多疑难杂症至今没有妥善的解决之道，连最高明的医生也束手无策。此时，我们就应该祈求药师如来的加持，认真修习药师法门。
1、持咒治病：咒语是诸佛的秘密语言，有不可思议的力量。经曰：药师如来为解除一切众生痛苦，入“除灭一切众生苦恼”三摩地，于肉髻中出大光明，光中宣说神咒。如果有人病了，在病人服用的药食或净水中，咒一百八遍，给病人服食，病患自然消除；而经常虔诚诵念此咒，还能免除种种病患，获得健康长寿的果报。
2、修延寿法：虽然人都有一死，但有人寿终正寝，有人意外横死，所谓横死是指那些因为特殊因缘而惨遭死亡的人。经中略举了九种：一、有病不得治疗或者治疗失误，病患一天天严重，终于导致死亡；二、被王法诛戮；三、喜欢猎获鸟兽，赌博淫欲，嗜酒无度，被非人夺精气死；四、焚死；五、溺死；六、恶兽啖食；七、堕入悬崖山谷；八、被毒药、咒诅或起尸鬼中伤而死；九、饿死。对于这种种横死的人，只要色身没有遭到严重破坏，通过修延寿法，可以起死回生，延长寿命。病人生命垂危之时，虽然还卧在病榻上，神识已到阎王所在之处，平生所作业相一一现前。在这危急的时刻，病人的亲属、朋友如能为彼归依药师如来，修习药师法门，经七日乃至四十九天，病人神识就能回到肉体上，如从梦中醒来。
修延寿的仪式：为病者七日七夜受持八分斋戒，办理饮食资具供养比丘僧，昼夜六时礼拜供养药师琉璃光如来，读诵《药师经》四十九遍，燃四十九灯，造药师如来形像七躯，一一像前各置七灯，一一灯量如大车轮，乃至四十九日光明不绝，造五色彩幡，长四十九桀手，放杂类众生四十九种，以此种种功德度过厄难。
也许有人会提出疑问：佛教讲因果，讲业力，人的一生是由业力决定的，修习药师法门又是怎么改变命运？须知佛教虽讲业力，但还讲缘起，业力是建立在缘起的基础上。修习药师法门是通过自己真诚的忏悔和药师如来的本愿力，改变成熟业力的客观条件，从而使恶业不再现前。
四、具足福德
组成人生幸福有两大因素：一者福德，一者智慧。一切生命中，唯有佛陀的福智二者都已彻底圆满，而凡夫众生总是或多或少有所欠缺。一个人缺少了福德势必会活得很不自在，诸如事业不顺利，所求不能得，这时就有必要修药师法门。
1、所求皆得：净信男女供养药师如来，造立形像，敷清净座安处之，散种种华，烧种种香，以种种幢幡庄严处所；七日七夜，受八分斋戒食清净食，澡浴香洁，着清净衣服，对一切众生起四无量心，利益安乐，念药师如来本愿功德，读诵《药师经》，思惟其义，学说开示。此人随所乐求，诸如长寿、富饶、官位、男女等，一切都能得到。
2、天神护持：受持读诵《药师经》，为他人学说开示、书写、恭敬尊重，以种种华香、涂香、末香、烧香、华鬘、璎珞、幡盖、伎乐供养，用五色彩作囊盛之，扫洒净处，敷设高座而安放四大天王及其眷属，无量百万天众都来供养守护，使得经典流通之处无诸横死，也不为诸恶鬼神夺其精气，即使夺了也还得如故，身心安乐。又有十二药叉大将，在闻佛说《药师经》后，共同发愿，尽形皈依三宝，作护法将，护持修习药师法门者，使其解脱一切厄难，获得种种利益。
世间上总是苦多乐少，因为造成人生痛苦的条件很多：有来自现实世界，也有来自幽冥世界。现实的灾难有时还可以防备或者躲避；冥冥中的侵犯却是无法防治的。这就有必要修习药师法门，取得护法神的护持，以诸佛菩萨及护法的力量去对治来自冥冥之中侵犯，自然是最好的策略。
