洪启嵩居士著
药师如来梵名Bhaisajya-guru-Vaidurya-prabharajah（药师琉璃光王），通称为药师琉璃光如来，简称药师佛。依《药师如来本愿经》（隋达磨笈多译），东方过娑婆世界十恒河沙佛土之外，有佛土名为净琉璃，其佛号为药师琉璃光如来。药师琉璃光如来之名号来源，是以能拔除生死之病名为药师，能照度三有之黑闇，故名琉璃光。现身为东方琉璃世界的教主，领导者日光遍照与月光遍照二大菩萨等眷属，化导众生。《药师经疏》引述药师佛与二大菩萨的由来，谓过去世界有电光如来出世，说三乘法度众生。尔时有一梵士养育有二子，见世界浊乱而发菩提心，要教化世界诸苦众生。佛以其发愿欲利重病众生，改其号为医王。二子皆饶益幽冥众生，长名日照，次名月照；尔时医王，即为东方药师如来，二子即为二大菩萨日光遍照菩萨、月光遍照菩萨。
药师如来的弘法利生工作，是秉持在行菩萨道时所发的十二大愿而来。这十二大愿满足众生世出世间的诸般愿求。在出世间上，药师佛希望在成就菩提时令一切有情如我无异、证得无上菩提等。而在世间上则有使众生饱满所欲而无令少、使一切不具者诸根完具、除一切众生众病、令身心安乐、使众生解脱恶王劫贼等横难等愿。
这些誓愿基本上，虽然也在促使众生早证菩提，但另一方面也著重于为众生求得现世的安乐。这与阿弥陀佛偏向来生往生极乐的安乐，有所不同。这也是佛教界称呼药师如来为消灾延寿药师佛，而将药师法会视为现生者消灾延寿法门的理由。
东方琉璃世界纯一清净，地为净琉璃所敷，城阙宫殿等。也都由七宝所成。其国土中无诸染欲，也没有三恶趣等苦恼。其庄严殊胜之处，宛如极乐世界阿弥陀佛的净土。
本经的同本异译有四译或五译的说法。实观的《药师经义疏》倡四译说：（一）宋孝武帝大明元年（西元四五七年）丁酉，沙门释慧简于秣棱（江苏、江宁县）鹿野寺译出，名为《药师琉璃光经》，亦名《灌顶拔除过罪生死得度经》。此经自《大灌顶经》第十二卷抄出。
（二）大业十一年（隋炀帝、西元六一五年）南印度罗啰国（此据《开元录》与《贞元录》；《大唐内典录》与《翻经图纪》则云为北天竺乌场国沙门达磨笈多及法行、明则、长顺、海驭等译，在东都（洛阳）洛水南上林园翻经馆重译，名为《药师如来本愿经》。
（三）唐代三藏法师玄奘在京师（长安）大慈恩寺翻经院译出，乃为现今之流通本。据《内典录》所载，可能为贞观年间翻译，但《开元录》及《贞元录》则以为是永徽元年（西元六五○年）五月五日所译，沙门慧立笔受。
（四）沙门义净于和帝（唐中宗）神龙三年（西元七○七年，此年九月改元景龙）丁未于佛光寺内翻译《药师琉璃光七佛本愿功德经》二卷。此经上卷总明东方药师七佛净土，下卷特明药师琉璃光佛净土及其本愿功德。与玄奘的译本约略相同。
比较前后各本，或简或繁文辞杂糅，傅之后徒或生疑惑。而唐玄奘的译本，在译文上咸认较为恰当，故成为流通之版本。
东晋之帛尸梨蜜多罗所译之《灌顶经》第十二卷，一名《佛说灌顶拔除过罪生死得度经》与《药师琉璃光经》同本。据实观的《药师经义疏》谓有九卷《灌顶经》，即（一）、《灌顶二千神王护比丘咒经》。（二）、《灌顶十二神王护比丘咒经》。（三）、《灌顶三归五戒带佩护身咒经》。（四）、《灌顶白结神王护咒经》。（五）、《灌顶宫宅神王守护左右咒经》。（六）、《灌顶冢墓因缘四方神咒经》。（七）、《灌顶伏魔封印大神咒经》。（八）、《灌顶摩尼罗亶大神咒经》。（九）、《灌顶召五方龙王摄疫毒神咒经》。而十二卷《灌顶经》是加上（十）、《佛说灌顶梵天神策经》。（十一）、《佛说灌顶随愿往生十方净土经》。（十二）、《佛说灌顶拔除过罪生死得度经》等三卷。但《灌顶随愿往生十方净土经》一卷是后汉灵帝光和年中（西元一七八一八三年）支谶所翻译的。而《佛说灌顶梵天神策经》有人以为是疑伪经。所以《灌顶经》的后三卷有可能是帛尸利蜜多罗的后人所附加。而十二卷《灌顶经》是《开元录》所记载，因此判断开元时代前所集成。
《药师经》的疑伪说最早出现于僧佑的《出三藏记》卷五新集伪撰杂录第三，其中说到：《灌顶经》一卷：一名《药师琉璃光经》，或名《灌顶拔除过罪生死得度经》；右一部宋孝武帝大明元年秣棱鹿野寺比丘慧简依经抄撰。而且因为慧简所抄撰之经，与东晋帛尸梨蜜多罗译的《佛说大灌顶神咒经》第十二《拔除过罪生死得度经》为同一经，故本经亦怀疑为疑伪经。
但从内容观察，疑伪说之论证，显然证据不足。
本经一开始是（一）序分。佛在毗舍离国广严城乐音树下说法。尔时文殊菩萨请佛演说诸佛名号及大愿功德，令闻者业障消除，以利乐像法诸有情等。
（二）明本誓利益十二大愿章：佛告文殊：去此东方十殑伽沙佛土，有净琉璃世界，佛号药师琉璃光如来十号俱足。彼佛于行菩萨道时，曾发利乐有情之十二大愿。
（三）果德章：说明药师佛土之庄严，与极乐世界等无差别。其国一向清净无有女人、恶趣。有无量菩萨众，而以日光遍照、月光遍照二大菩萨为上首。
（四）佛号功德章：明听闻及忆念佛号之种种功德。因听闻及忆念药师佛号能使布施、持戒、精进、忍辱诸波罗蜜速得圆满。亦能解脱一切魔难、咒术、障碍，恒生善道。
（五）八大菩萨章：明佛弟子若能长时受持八分斋戒者，以此善根愿生西方极乐世界无量寿佛所，而未能决定者；若听闻药师佛的名号，临命终时，佛遣文殊师利菩萨、观世音菩萨、得大势菩萨、无尽意菩萨、宝檀华菩萨、药王菩萨、药上菩萨、弥勒菩萨等八大菩萨，示其道路，极乐化生。
（六）转女成男章：若为女人，至心持念药师佛号，能得转女成男。
（七）药师真言章：演说药师真言及其种种功德、使用方法。
（八）文殊章：文殊菩萨誓于像法时，以种种方便，令诸净信得闻药师佛名号。若能称扬药师名号及受持此经，则四大天王及其眷属将供养守护。且能免除一切横死，及诸恶鬼神侵扰等。
（九）阿难章：佛问阿难，是否信解药师佛之功德。阿难言：我于如来所说契经，不生疑惑。
（十）救脱菩萨章：救脱菩萨问佛：诸众生为病患所困，死相现前，琰魔法王与俱生神交涉时，如何解脱？佛告以病人亲属、知识，若能为彼皈依药师如来，读诵《药师经》，燃七层之灯，悬续命五色神旛，供养药师佛，经七日、二十一日、三十五日或四十九日，彼神识得还。救脱菩萨复对阿难说明，续命旛灯造法；及帝王如何解脱治国之七难，而得七福。复次救脱菩萨复对阿难解说，供养药师佛可脱离九种横死。
（十一）十二神将章：会中有十二药叉大将，各有七千药叉为眷属，同白佛言：誓愿拥护药师琉璃光如来法门。若有受持药师佛名号及供敬、供养、流布《药师经》者，彼将使之解脱一切苦难。并教以若有疾厄，求度脱者，读诵此经，以五色缕结十二药叉神将名字，得如愿已，然后解结。以上为此经大意。
而唐义净于神龙三年翻译之《药师琉璃光七佛本愿功德经》有上下二卷。其内容大要如下：
【卷上】1、此经的说处与听众。2、此经之启请者曼殊师利法王子。3、为未来世像法众生说此经。4、东方过四殑伽河沙佛土的光胜世界有善名称吉祥王如来，行菩萨道时立八大愿。5、东方过五殑伽河沙佛土的妙宝世界有宝月智严光音自在王如来，建立有八大愿。6、东方过六殑伽河沙佛土的圆满香积世界有金色宝光妙行成就如来，建立有四大行愿。7、东方过七殑伽河沙佛土的无忧世界有无忧最胜吉祥如来，建立有四大行愿。8、东方过八殑伽河沙佛土的的法幢世界有法海雷音如来，建立有四大行愿。9、东方过九殑伽河沙佛土的的善位世界有法海胜慧游戏神通如来，建立四大行愿。10、东方过十殑伽河沙佛土的净琉璃世界有药师琉璃光如来，建立十二行愿。
【卷下】11、净琉璃世界之净土功德及日光、月光菩萨。12、无量寿佛与药师如来。13、药师如来真言。14、七佛供养法。15、七佛如来甚深功德。16、琰魔法王。17、四十九灯与杂彩旛四十九首。18、救脱菩萨。19、十二药叉大将。20、如来定力琉璃光大神咒。21、八戒斋。22、执金刚菩萨。23、于佛像身安佛舍利。24、未来世后五百岁，法灭时护持是经。25、此经之各种名称。
